原核表達是指通過基因克隆技術，將外源目的基因，通過構建表達載體并導入表達菌株的方法，使其在特定原核生物或細胞內表達。原核蛋白表達系統是目前常用、經濟的蛋白表達方法。大腸桿菌表達系統是應用廣泛的原核蛋白表達系統之一。

　　一個完整的表達系統通常包括配套的表達載體和表達菌株。如果是特殊的誘導表達還包括誘導劑，融合表達還包括純化系統或者Tag檢測等等。選擇表達系統通常要根據實驗目的來考慮，比如表達量高低，目標蛋白的活性，表達產物的純化方法等等。下面介紹下原核表達過程中常見問題。

　　1、為什么目的蛋白總是以包涵體形式出現?

　　在原核表達純化中目的蛋白經常發生錯誤折疊，并聚集成為包涵體。經過誘導后目的蛋白表達通常可達細胞總蛋白的50%以上，雖然有一定比例的蛋白以可溶形式存在，多達95%的蛋白則存在于包涵體。為了獲得更多可溶蛋白，在實驗過程中，可以降低誘導溫度，例如16-30℃，或降低IPTG濃度（0.01-0.1mM）并延長誘導時間，還可以采用特別的培養基培養細菌。

　　2、跨膜蛋白為什么很難表達?

　　跨膜蛋白的表達成功率相對較低是一個常見問題，主要原因可能有兩個：

　　1.跨膜蛋白一般都是強疏水性的氨基酸分子和親水性的分子跳躍式鏈接，形成的親水疏水的一個簡單的跨膜化學結構，這種結構和信號肽結構形似。而對于原核細胞來說，簡單的細胞器很難像真核細胞一樣完成信號肽的識別及切除、引導內質網、高爾基體重新包裝及分泌這一復雜過程，有些蛋白多次跨膜，對于原核細胞來說幾乎是不可能完成的任務。

　　2.對于疏水性片段，在原核細胞表達中非常容易形成包涵體，疏水性多肽會抑制翻譯過程，甚至與原核膜結構融合形成毒性，處于生物自我保護的本能，所有細胞器都會停止合成蛋白的過程。